Građevno projektni zavod strukturiran je kroz osam stručno specijaliziranih grupa, njih čine i vode iskusni inženjeri i stručnjaci. Svaka grupa funkcionira kao samostalna i neovisna jedinica, a kada zahtjevi projekta to nalažu više grupa se udružuje i nastupa kao jedna, kako bi pružili kompletnu uslugu.
O bogatom radnom iskustvu i uspjehu svake od grupa kao i grupa udruženih u zajedničke projekte najbolje govori duga lista referentnih projekata.